分かりやすい図がありましたのでちょっと拝借しました。
健康な人の内臓は以下のようになっています。
食物は胃から十二指腸に入ってそこで消化液でさらに細かく消化されます。
上図の胃の部分が全部なくなります。
食道を空腸を接続することになります。その途中に十二指腸を接続します。
その先に回腸が接続されます。十二指腸の先と空腸を接合して、その部分で食物と消化液が出会うことになります。
最近はもっと複雑なつなぎ方で逆流性をなくす工夫がなされているようです。
十二指腸と空腸を直結しなかったのも逆流性を防止するためです。